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Résultats du premier Décrypthon

Pour promouvoir l’utilisation de la base Décrypthon, l’AFM a lancé courant 2003 un appel d’offres, selon les procédures habituelles. Quatre projets de recherche ont été sélectionnés et ont reçu un financement, avec comme condition l’utilisation de cette base.
Deux équipes du Département des Sciences de la Vie du Commissariat à l’Energie Atomique de Saclay (S Zinn-Justin et R Guerois) en association avec A Poupon, du CNRS, laboratoire de génomique structurelle de la levure de l’université d’Orsay visait à élucider les relations structure/fonction au sein des protéines de la levure et de l'homme impliquées dans le maintien de l'intégrité génomique du noyau. Leurs travaux ont abouti à deux publications (Coeytaux K et Poupon A. Prediction of unfolded segments in a protein sequence based on amino acid composition. Bioinformatics, 2005, 21, 1891-1900, et Charier G, et al. Tudor tandem of 53BP1: a new structural motif involved in DNA and RG-rich peptide binding. Structure, 2004, 9, 1551-1562).

 
Trois équipes de l’IGBMC d’Illkirch : J Laporte et J-L Mandel, A Pujol et J-L Mandel, G Bey, F Sirockin, F Plewniak et O Poch ont proposé trois projets de complexité croissante :
  • Un premier projet au niveau d’un protéome concernait l’identification et la caractérisation des myotubularines, des protéines impliquées dans plusieurs maladies neuromusculaires, ainsi que la prédiction des domaines protéiques et des fonctions tissu-spécifiques.
    Leurs travaux ont abouti à deux publications (J Laporte et J-L Mandel : Myotubularins, a large disease-associated family of cooperating catalytically active and inactive phosphoinositides phosphatases. Hum Mol Genet. 2003, 12 Spec No 2:R285-292 et Production of phosphatidylinositol 5-phosphate by the phosphoinositide 3-phosphatase myotubularin in mammalian cells - J Biol Chem. 2004,279:7304-7312).
  • Un deuxième projet a consisté à l’analyse des protéines d’un organite cellulaire, le peroxisome, qui est impliqué dans de nombreuses fonctions métaboliques essentielles. Leurs travaux ont abouti à une publication. (A Pujol et J-L Mandel, The evolutionary origin of peroxisomes: an ER-peroxisome connection.Mol Biol Evol. 2006 ; 23:838-485).
  • Le troisième projet, à l’échelle d’un organisme, consistait à l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles chez Vibrio cholerae et les organismes Diabac (Diarrhoeal Bacteria) impliquées dans les pathologies diarrhéiques.
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