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Janvier 2007 : Décrypthon est lancé sur grille PC

 
C’est officiel : Le Programme Décrypthon s'enrichit de l'arrivée d'une grille de calculs internautes pour l’ambitieux projet d'assemblage moléculaire de l’équipe d’A.Carbone.
 
Ce projet appelé "Help Cure Muscular Dystrophy" a pour but d'étudier la modélisation des interactions protéine-protéine de 4 000 protéines, en se concentrant sur celles qui jouent un rôle dans les maladies neuromusculaires. Dans un premier temps, c'est une phase de test qui vient d'être lancée, calculant les interactions de 336 protéines sous Windows. Pour la deuxième phase du projet, de plus grande ampleur, les calculs seront aussi réalisés par les systèmes d'exploitations Linux et Mac.

Les informations obtenues aideront les chercheurs à concevoir les molécules susceptibles d'inhiber ou de favoriser la liaison de molécules particulières et ainsi trouver des traitements contre les myopathies et d'autres pathologies neuromusculaires.

Vous pouvez contribuer au succès de ce projet en mettant la puissance de calcul de votre ordinateur à la disposition des chercheurs. Il suffit de vous inscrire à World Community Grid et ainsi, votre PC aide la recherche lorsque vous ne l’utilisez pas.
 
 
L'ambition scientifique
Aujourd’hui, la recherche en sciences de la vie a de plus en plus besoin de puissance de calcul et d'espace de stockage. En effet, tous les ans, le volume de données en biologie est multiplié par deux. Capitalisant sur leur expérience de 2001, l’AFM et IBM décident de s’associer au CNRS pour mettre en place le programme Décrypthon. Son objectif : accélérer la recherche en protéomique et génomique grâce au grid computing. Sa durée : 3 années jusqu'à fin 2007.
 
 
Le programme Décrypthon vise à accélérer la recherche en génomique et protéomique. Mieux comprendre le fonctionnement et le rôle des protéines, prédire leur fonction si elle est inconnue, progresser dans la connaissance de leur structure en 3 dimensions, croiser les données du protéome (ensemble des protéines) et celles du génome (ensemble des gènes)… ce sont autant d’étapes franchies vers la mise au point de thérapies innovantes pour les maladies génétiques encore incurables. Pour cela, le programme Décrypthon vise à accueillir sur sa plate-forme technologique une dizaine de projets scientifiques sélectionnés par appel d’offres.
Le défi technologique
Il existe aujourd’hui une arme efficace pour prendre la maladie de vitesse : le grid computing. Les technologies dites de « grilles» permettent de mettre en commun (en grille) les capacités disponibles de plusieurs supercalculateurs et/ou de simples ordinateurs personnels. Elles offrent ainsi à la recherche la puissance de calcul nécessaire au traitement des données complexes de la biologie d’aujourd’hui.
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